Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mis18aQ9CZJ6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mis18aQ9CZJ6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms