Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CYI0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms