Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Atg12Q9CQY1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Atg12Q9CQY1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms