Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sar1bQ9CQC9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1bQ9CQC9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms