Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp2Q9CQ73 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp2Q9CQ73 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms