Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prss29Q99MS4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms