Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tlr3Q99MB1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr3Q99MB1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms