Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apobec3Q99J72 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms