Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csmd1Q923L3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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