Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atl3Q91YH5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atl3Q91YH5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms