Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps3Q91VB4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hps3Q91VB4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms