Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sgms1Q8VCQ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sgms1Q8VCQ6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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