Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ssx2ipQ8VC66 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssx2ipQ8VC66 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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