Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms