Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpc3Q8CFZ4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpc3Q8CFZ4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms