Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hpf1Q8CFE2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hpf1Q8CFE2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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