Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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Pggt1bQ8BUY9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Pggt1bQ8BUY9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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