Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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