Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm2Q8BGA3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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