Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc172Q810N9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms