Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ntf4Q80VU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ntf4Q80VU4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ntf4Q80VU4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ntf4Q80VU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ntf4Q80VU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms