Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rexo1Q7TT28 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms