Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Dsg1cQ7TSF0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms