Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Nek5Q7TSC3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nek5Q7TSC3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms