Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmc3Q7TQ69 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmc3Q7TQ69 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmc3Q7TQ69 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tmc3Q7TQ69 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmc3Q7TQ69 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms