Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Scn4bQ7M729 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn4bQ7M729 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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