Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kcnt1Q6ZPR4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnt1Q6ZPR4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms