Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja6Q6S5G4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms