Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Taf1cQ6PDZ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Taf1cQ6PDZ2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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