Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cachd1Q6PDJ1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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