Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp49Q6P9L4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp49Q6P9L4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp49Q6P9L4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Usp49Q6P9L4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp49Q6P9L4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp49Q6P9L4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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