Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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