Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Zfp248Q640N4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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