Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp1Q62209 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms