Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prkd1Q62101 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms