Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Itga6Q61739 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms