Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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