Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Bbs12Q5SUD9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms