Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psme4Q5SSW2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psme4Q5SSW2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms