Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sun3Q5SS91 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sun3Q5SS91 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sun3Q5SS91 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sun3Q5SS91 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sun3Q5SS91 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sun3Q5SS91 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms