Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Syne3Q4FZC9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syne3Q4FZC9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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