Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TceancQ3US16 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TceancQ3US16 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms