Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D13Ertd608eQ3UPR8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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D13Ertd608eQ3UPR8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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