Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf40Q3U319 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf40Q3U319 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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