Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smyd5Q3TYX3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms