Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2afvQ3THW5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms