Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Prr27Q3SYJ2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prr27Q3SYJ2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prr27Q3SYJ2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prr27Q3SYJ2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prr27Q3SYJ2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms