Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fam171bQ14CH0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fam171bQ14CH0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms