Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cntnap5bQ0V8T8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cntnap5bQ0V8T8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms