Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fbln1Q08879 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms